С точки зрения архитектурной деятельности эпоха Караханидов оставила яркий след в виде многочисленных дворцов, мечетей, медресе, мостов и караван-сараев. При Мухаммеде б. Сулеймане II в Бухаре началась бурная строительная деятельность.
От мечетей, построенных в то время, сегодня остались лишь минареты, которые и являлись новшеством караханидской архитектуры. Развитие получило и строительство гробниц. Внимание привлекают их монументальные двери, являющие собой произведения искусства. Караван-сараи, построенные при Караханидах, во многом повлияли на последующие эпохи.
Караханиды боролись с уйгурами-буддистами и другими неисламскими элементами для защиты и распространения Ислама. Кроме того, они явились представителями тюркско-исламской культуры, сочетая Исламские элементы с собственными традициями.